Tropicale. Le coste sono molto calde tutto l'anno mentre sui rilievi andini le temperature variano a secondo dell'altitudine con punte notturne sotto lo zero. La zona amazzonica è molto umida ed ha un clima più temperato.

Vaccinazioni obbligatorie nessuna, consigliate Tetano, Epatite A, Febbre Tifoide e Febbre Gialla ( presente nelle foreste ). Il rischio di Malaria, principalmente nella forma benigna P.vivax esiste tutto l'anno al di sotto dei 1500m in alcune zone rurali. Evitare alimenti crudi ed acqua non imbottigliata. Tra le malattie trasmesse da insetti è presente la Tripanosomiasi americana (malattia di Chagas), la Leishmaniosi cutanea e l'oncocercosi.